O fundo é composto principalmente por correspondência relativa às suas atividades profissionais. São cartas trocadas entre colegas, com instituições científicas, de pesquisa e ensino, nacionais e internacionais. As cartas trocadas com seu irmão Ademar, também geneticista, envolvem tanto questões familiares quanto profissionais. A correspondência familiar inclui diversas "circulares", com mensagens para vários membros da família em um mesmo item. Há também correspondência com padres e religiosos. Além de correspondência, o fundo inclui produção intelectual do titular e sobre ele, diplomas e certificados, relatórios de viagens, currículos, fotos e vídeos de eventos, entre outros.
Correspondência de Adelaida González de Díaz Ungría para NFM. 2 cartas. Intercâmbio de informações científicas e instalação do laboratório de antropologia física.
O Programa Meu Paraná faz uma homenagem ao professor Newton Freire-Maia. O programa conta com depoimentos do próprio Newton e de diversos alunos, colaboradores e amigos, sobre sua trajetória e o impacto da sua obra na ciência brasileira.
Documentos relacionados com a formação escolar e acadêmica de Newton Freire-Maia, incluindo curso no Ginásio Municipal de Varginha, na Escola de Farmácia e Odontologia de Alfenas, de Biologia Geral na USP, seu doutorado, seu estágio em Ann Arbor e outros cursos frequentados por ele.