O fundo é composto principalmente por correspondência relativa às suas atividades profissionais. São cartas trocadas entre colegas, com instituições científicas, de pesquisa e ensino, nacionais e internacionais. As cartas trocadas com seu irmão Ademar, também geneticista, envolvem tanto questões familiares quanto profissionais. A correspondência familiar inclui diversas "circulares", com mensagens para vários membros da família em um mesmo item. Há também correspondência com padres e religiosos. Além de correspondência, o fundo inclui produção intelectual do titular e sobre ele, diplomas e certificados, relatórios de viagens, currículos, fotos e vídeos de eventos, entre outros.
Lílian de Sá Affonso da Costa (prima), Maria Helena Araújo Costa (prima), Neusa Feitosa Affonso da Costa, Newton Carneiro Affonso da Costa e Luiz Gastão de Alencar (amigo)
